Alienoid 2: Return To The Future อีอานติดอยู่ในอดีตขณะที่พยายามหยุดการหลบหนีของนักโทษต่างดาวที่อยู่ในร่างมนุษย์ เธอพบดาบศักดิ์สิทธิ์ที่สามารถเปิดประตูมิติข้ามเวลาได้ ตอนนี้เธอต้องตามหาธันเดอร์เพื่อกลับสู่ปัจจุบัน ในขณะเดียวกัน มูรุคผู้ช่วยอีอานจากอันตราย เริ่มรู้สึกถึงสิ่งมีชีวิตแปลก ๆ ในร่างกายของเขาและรู้สึกไม่สบายใจ เมื่อกลับมาที่ปัจจุบัน การแพร่กระจายของก๊าซฮาวาโดยผู้นำนักโทษต่างดาวทำให้มีผู้เสียชีวิตหลายพันคน มินกาเอลินที่บังเอิญเห็นเหตุการณ์นี้ ได้ตระหนักว่านี่เป็นเพียงจุดเริ่มต้นเท่านั้น...